Hlavný hrdina hry Sora sa snaží zistiť, čo stálo za zničením jeho sveta a taktiež hľadá cestu, ako sa znova stretnúť s jeho dvoma najlepšími kamarátmi. Popri tom stretáva známe Disney postavy ako Goofy, Donald a Mickey, ale aj postavy z Pirátov z Karibiku alebo hernej série Final Fantasy.