Príbeh sa odohráva 10 rokov po udalostiach v Bioshocku, v dystopickom meste Rature v 1970-tych rokoch. Hráč je Big Daddy, bytosť, ktorej orgány a koža sú zasadené do atmosferického potápačského úboru. Po tom, čo sa po desiatich rokoch prebudí, pokúša sa nájsť Malú Sestru, s ktorou bol spolu pred des...